南少林和北少林二者同出一宗，北少林在先，是北少林僧侣南下创办南少林的。

南少林寺在清朝已被清朝镇压毁灭，不复存在。

北少林寺即嵩山少林寺，有“禅宗祖廷，天下第一名刹”之誉；是中国佛教禅宗祖庭，位于河南登封城西少室山。

据《兴化府志》记载：莆田“南少林寺”原名“林泉院”，建于南朝陈永定元年(公元557年)，比莆田置县早11年，较嵩山少林寺晚建61年。

关于泉州少林寺，据《晋江县志》与《泉州府记》记载：泉州少林寺建于唐乾符(公元874~879年)年间，原名“镇国东禅少林寺”，今名“东禅寺”。

至于福清南少林寺，在一些史书如《八闽通志》、《三山志》以及清乾隆皇帝钦定的《四库全书》中，虽然有“福清少林”字样，但创建时间却无详细的文字记载。