综合多组学分析对 CLL 中不同的致病过程进行分类
一个国际研究小组现已通过分析多层次的编码生物信息,对来自慢性淋巴细胞白血病 (CLL) 患者的 700 多个肿瘤样本进行了全面的分析和分类。
通过对衍生信息的详细映射,他们确定了与对不同治疗组合的不同耐药模式相关的主要生物学类别。
除了指示异质性炎症活动水平的变化外,基因组不稳定性的程度被证明是肿瘤亚组的主要鉴别特征。
在癌症生物学中,高度的基因组不稳定性增加了基因组改变的可能性,并且在很大程度上取决于肿瘤识别和修复获得性 DNA 损伤的能力。
CLL 中的基因组不稳定性与编码用于基因组保护的细胞观察器(即所谓的肿瘤抑制基因)的区域的突变或染色体丢失有关。
表现出抑癌基因失活的肿瘤通常预后不佳,早期发现有助于选择最合适的治疗方法。然而,基因组不稳定性也发生在许多没有这种可检测到的改变的 CLL 病例中。
正如 Johannes Bloehdorn(乌尔姆大学)及其同事在Nature Communications中报道的那样,肿瘤样本分析包括对基因突变、染色体畸变、DNA 甲基化、基因和蛋白质表达以及相关通路信号活性的评估。
作者能够解码肿瘤生物学并以某种方式翻译基础信息,从而可以对肿瘤进行分类,而不管肿瘤抑制基因或 DNA 修复基因的可检测损失或突变如何。
作者进一步发现,基因组不稳定的肿瘤不仅会关闭 DNA 修复,还会显示出增强且极易出错的修复活动。这进一步增加了基因组改变的积累率,加速了耐药性的发展。
在这项研究中确定的另一个主要亚群显示出最低程度的基因组不稳定性,表现出在实体瘤转移过程中观察到的特征,这些特征以前不知道在 CLL 中建立亚群特异性功能网络。
CLL 细胞可以通过血流到达身体的任何部位。因此,开发使细胞能够脱离肿瘤以寻找更好的生存环境的机制似乎是多余的,这表现为实体瘤的转移过程。
然而,这些未发现的网络可能会增加白血病细胞离开血流并迁移到淋巴组织的能力。几种靶向治疗方法解决了相关机制和细胞在淋巴器官中积聚的能力。